Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd1Q01822 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms