Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top2aQ01320 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2aQ01320 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms