Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pitx2P97474 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pitx2P97474 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms