Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Bop1P97452 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Bop1P97452 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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