Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkp1P97350 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkp1P97350 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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