Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NfixP70257 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfixP70257 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfixP70257 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfixP70257 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfixP70257 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfixP70257 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfixP70257 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfixP70257 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfixP70257 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfixP70257 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms