Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms