Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp25P57080 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp25P57080 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp25P57080 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms