Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf5P56477 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms