Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PctpP53808 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PctpP53808 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PctpP53808 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms