Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SqleP52019 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SqleP52019 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SqleP52019 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SqleP52019 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SqleP52019 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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