Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccr3P51678 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms