Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SftpbP50405 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SftpbP50405 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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