Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxc13P50207 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxc13P50207 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxc13P50207 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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