Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VdrP48281 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VdrP48281 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms