Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TtlP38585 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtlP38585 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtlP38585 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TtlP38585 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TtlP38585 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms