Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprkP35822 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtprkP35822 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprkP35822 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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