Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd1P33215 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nedd1P33215 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms