Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rom1P32958 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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