Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RxraP28700 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RxraP28700 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxraP28700 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxraP28700 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxraP28700 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxraP28700 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxraP28700 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RxraP28700 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RxraP28700 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RxraP28700 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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