Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgfb2P27090 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgfb2P27090 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgfb2P27090 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgfb2P27090 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgfb2P27090 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfb2P27090 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms