Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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PdgfraP26618 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PdgfraP26618 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PdgfraP26618 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PdgfraP26618 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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