Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd12P23812 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd12P23812 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms