Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RarbP22605 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RarbP22605 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RarbP22605 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RarbP22605 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RarbP22605 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RarbP22605 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RarbP22605 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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