Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VimP20152 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VimP20152 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VimP20152 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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