Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NefhP19246 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NefhP19246 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NefhP19246 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NefhP19246 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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