Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnnc1P19123 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms