Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PcnaP17918 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PcnaP17918 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms