Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nr4a1P12813 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms