Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf1P09925 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf1P09925 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms