Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FxnO35943 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FxnO35943 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FxnO35943 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FxnO35943 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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FxnO35943 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FxnO35943 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FxnO35943 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FxnO35943 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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