Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms