Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrt1O35449 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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