Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Degs1O09005 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Degs1O09005 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Degs1O09005 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms