Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp35M0QWN7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms