Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubgcp6G5E8P0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms