Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms