Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm17727E9Q4V7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Gm17727E9Q4V7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm17727E9Q4V7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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