Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd1D3YXK1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd1D3YXK1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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