Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clip3B9EHT4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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