Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rd3lB2RV38 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rd3lB2RV38 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms