Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rrn3B2RS91 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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