Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpb1B2RS76 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms