Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms