Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik3B1AS29 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Grik3B1AS29 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Grik3B1AS29 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grik3B1AS29 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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