Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms