Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ubl3Q9Z2M6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms