Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms