Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a3Q9QZS0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col4a3Q9QZS0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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