Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf25Q9QZR0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf25Q9QZR0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf25Q9QZR0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf25Q9QZR0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf25Q9QZR0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf25Q9QZR0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf25Q9QZR0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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